金坛中华绒鳌蟹养殖区抗生素抗性基因的高通量测序初步研究开题报告

 2024-08-14 07:08

1. 本选题研究的目的及意义

抗生素作为一种有效的治疗细菌感染的药物,已被广泛应用于人类和动物的疾病防治。

然而,抗生素的过度使用和滥用导致了抗生素抗性基因(AntibioticResistanceGenes,ARGs)的出现和传播,对全球公共卫生安全构成严重威胁。

水产养殖环境作为ARGs的重要储存库和传播媒介,其ARGs污染状况日益受到关注。

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2. 本选题国内外研究状况综述

近年来,抗生素抗性基因(ARGs)作为一种新兴污染物,其环境风险和生态效应受到全球范围的广泛关注。

国内外学者围绕ARGs在不同环境介质中的赋存特征、迁移转化规律、生物风险及控制技术等方面开展了大量研究工作。


国内研究现状:国内学者较早关注了ARGs在水环境中的污染状况,特别是在污水处理厂、河流、湖泊等环境介质中的分布特征、迁移规律以及潜在风险。

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3. 本选题研究的主要内容及写作提纲

本研究将以金坛中华绒螯蟹养殖区为研究对象,采用高通量测序技术,对该区域水体、沉积物和中华绒螯蟹肠道等环境介质中的ARGs进行全面分析,并结合环境因子,探讨ARGs的污染水平、分布特征、潜在传播风险及影响因素。

主要内容包括以下几个方面:1.金坛中华绒螯蟹养殖区环境样品的采集和处理:a.选取具有代表性的中华绒螯蟹养殖池塘,采集水体、沉积物和中华绒螯蟹肠道等样品。

b.对采集的样品进行预处理,包括水样的过滤、沉积物样的干燥和研磨以及肠道样品的提取等。

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4. 研究的方法与步骤

本研究将采用高通量测序技术结合生物信息学分析方法,对金坛中华绒螯蟹养殖区ARGs进行系统研究。

具体步骤如下:1.样品采集:a.在金坛选择具有代表性的中华绒螯蟹养殖池塘,采集水体、沉积物和中华绒螯蟹肠道等样品。

b.水样:利用无菌水sampler在水面下0.5米处采集1L水样,过0.22μm滤膜,将滤膜于-80℃保存。

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5. 研究的创新点

本研究的创新点主要体现在以下几个方面:
1.研究对象新颖:本研究以金坛中华绒螯蟹养殖区为研究对象,聚焦于中华绒螯蟹养殖环境中的ARGs污染,填补了该领域研究的空白。


2.研究方法先进:本研究采用高通量测序技术,能够全面、准确地分析环境样品中ARGs的种类、丰度和多样性,克服了传统培养方法的局限性。


3.研究内容系统:本研究不仅分析了ARGs的污染现状,还结合环境因子,探讨了ARGs的潜在传播风险和影响因素,为ARGs的风险评估和防控提供了科学依据。

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6. 计划与进度安排

第一阶段 (2024.12~2024.1)确认选题,了解毕业论文的相关步骤。

第二阶段(2024.1~2024.2)查询阅读相关文献,列出提纲

第三阶段(2024.2~2024.3)查询资料,学习相关论文

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7. 参考文献(20个中文5个英文)

1. 黄海燕,董慧茹,濮文,等. 基于高通量测序的鸡源大肠杆菌耐药基因检测及生物信息学分析[J]. 中国畜牧兽医,2022,49(12):4203-4212.

2. 韩旭,张晓君,刘玉环,等. 水产养殖环境中抗生素抗性基因污染及传播风险研究进展[J]. 中国水产科学,2021,28(03):412-424.

3. 陈梦林,徐进,王海,等. 水产养殖系统抗生素抗性基因(ARGs)污染特征及传播扩散[J]. 生态毒理学报,2020,15(03):8-18.

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