1. 研究目的与意义
儿童呼吸系统疾病是一类常见病,对儿童的健康有着严重威胁。
一般包括肺间质疾病(ILD)、支气管哮喘、呼吸道感染、结核病、睡眠与呼吸障碍性疾病、罕见病和其他呼吸系统疾病等。
而儿童呼吸系统疾病的研究常常包括细胞、体液、生物代谢物等等的代谢组学研究。
2. 文献综述
儿童呼吸系统疾病代谢组学数据处理方法建立何瑜芳摘要 儿童呼吸系统疾病是常见病,代谢组学对其治疗有着重要意义。
代谢组学研究会产生大量数据,这些数据十分复杂,数据处理就尤为重要。
故本文介绍了儿童呼吸系统疾病代谢组学多种数据处理方法,步骤,及适用软件和技术。
3. 设计方案和技术路线
研究方案:1.查阅相关文献、提前熟悉课题所涉及的理论知识,并掌握;2.研究仪器自带数据处理软件的使用方法,软件包括SIEVE、Xcalibur、Simca-P、SPSS、Mass Frontier等。
3.研究新型数据处理软件xMSanalyzer,探讨如何提取低丰度色谱峰以及提取更多的高质量色谱峰等问题,以提高代谢产物峰值检测与数据分析的质量。
4.对比两种软件的优缺点,结合两种软件来完善数据处理。
4. 工作计划
第一阶段:2022.01-2022.02文献查阅、确定实验课题;第二阶段:2022.02-2022.03熟悉仪器、撰写开题报告;第三阶段:2022.03-2022.05确定实验方案、进行实验;第四阶段:2022.05-2022.06整理数据,撰写毕业论文。
5. 难点与创新点
代谢组学研究会产生大量的数据,这些数据具有复杂的特征:高噪声、高维、小样本、高变异性;相互作用关系复杂;相关性和冗余性;分布的不规则和稀疏性等。
这些特点使得数据的处理与分析过程十分繁琐复杂,急需自动处理方法。
近年来代谢组学研究的热点和难点就集中在如何从复杂的代谢组学数据中提取出有价值的信息,筛选出潜在的生物标志物。
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