开发基于序列的酶学高通量注释系统开题报告

 2023-07-19 00:53:26

1. 研究目的与意义(文献综述包含参考文献)

一、简介 对酶功能进行准确的注释需依赖于基因组序列。

基因组序列注释是利用生物信息学方法和工具,对基因组所有基因的生物学功能进行高通量注释,是当前功能基因组学研究的一个热点。

基因组注释的主要内容是: 鉴定出基因组内的基因,确定基因的结构,推断出基因可能的功能,并预测相关的酶的功能。

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2. 研究的基本内容、问题解决措施及方案

研究或解决的问题:1.掌握brenda数据库相关的文献2.使用多重序列比对工具对brenda中特定酶系进行聚类分析3.使用blast系列软件构建brenda中特定酶系的数据库4.应用所构建的数据库对若干基因组进行酶学注释评估。

研究手段:1.运用其他已知的工具相结合,设置一个脚本,将网站上酶基因组序列的功能注释添加进系统。

2.编辑python脚本,构建本地化(特定brenda子集中的)酶子库的聚类分析平台。

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